Examinando por Autor "Leal Esquivel, Alejandro"
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Ítem Amerindian ancestry and extended longevity in Nicoya, Costa Rica(American Journal of Human Biology,vol.30(1), 2018) Azofeifa Navas, Jorge; Ruiz Narváez, Edward A.; Leal Esquivel, Alejandro; Gerlovin, Hanna; Rosero Bixby, LuisObjectives: The aim of this study was to address the hypothesis that Amerindian ancestry is associated with extended longevity in the admixed population of Nicoya, Costa Rica. The Nicoya Peninsula of Costa Rica has been considered a “longevity island,” particularly for males. Methods: We estimated Amerindian ancestry using 464 ancestral informative markers in 20 old Nicoyans aged 99 years, and 20 younger Nicoyans (60-65 years). We used logistic regression to estimate odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) of the association of Amerindian ancestry and longevity. Results: Older Nicoyans had higher Amerindian ancestry compared to younger Nicoyans (43.3% vs 36.0%, P5.04). Each 10% increase of Amerindian ancestry was associated with more than twice the odds of being long-lived (OR52.32, 95% CI51.03-5.25). Conclusions and Implications: To our knowledge, this is the first time that ancestry is implicated as a likely determinant of extended longevity. Amerindian-specific alleles may protect against early mortality. The identification of these protective alleles should be the focus of future studies.Ítem Correlates of longitudinal leukocyte telomere length in the Costa Rican Longevity Study of Healthy Aging (CRELES): On the importance of DNA collection and storage procedures(PLoS ONE, vol.14(10), 2019) Rosero Bixby, Luis; Rehkopf, David H.; Dow, William H.; Lin, Jue; Epel, Elissa S.; Azofeifa Navas, Jorge; Leal Esquivel, AlejandroThe objective is to identify cofactors of leukocyte telomere length (LTL) in a Latin American population, specifically the association of LTL with 36 socio-demographic, early childhood, and health characteristics, as well as with DNA sample collection and storage procedures. The analysis is based on longitudinal information from a subsample of 1,261 individuals aged 60+ years at baseline from the Costa Rican Study of Longevity and Healthy Aging (CRELES): a nationally representative sample of elderly population. Random effects regression models for panel data were used to estimate the associations with LTL and its longitudinal changes. Sample collection procedures and DNA refrigerator storage time were strongly associated with LTL: telomeres are longer in blood collected in October-December, in DNA extracted from <1-year-old blood cells, and in DNA stored at 4°C for longer periods of time up to five years. The data confirmed that telomeres are shorter at older ages, as well as among males, and diabetic individuals, whereas telomeres are longer in the high-longevity Nicoya region. Most health, biomarkers, and early childhood indicators did not show significant associations with LTL. Longitudinal LTL variation over approximately two years was mainly associated with baseline LTL levels, as found in other studies. Our findings suggest that if there is unavoidable variability in season of sample collection and DNA storage time, these factors should be controlled for in all demographic and epidemiologic studies of LTL. However, due to unobserved components of measurement variation, statistical control may be inadequate as compared to standardization of data collection procedures.Ítem Determinación de las mutaciones presentes en los genes MPZ, MED25, GJB1, GDAP1, de la duplicación del GEN PMP22 y establecimiento de la correlación genotipo-fenotipo en individuos costarricenses afectados con la enfermedad de Charcot-Marie-Tooth(2013) Sánchez Chacón, Silvia; Leal Esquivel, AlejandroCharcot Marie Tooth (CMT), es la enfermedad hereditaria del sistema nervioso periférico más común, provocada por daños progresivos en el sistema nervioso periférico. Las mutaciones que disparan su desarrollo se localizan en genes expresados en células neuronales y de Schwann. Debido a la alta heterogeneidad genética se puede observar patrones de segregación mendeliana autosómicos dominantes, recesivos y ligados al cromosoma X. Mutaciones en los genes MED25, MPZ, GJB1, GDAP1 y la duplicación del gen PMP22 fueron evaluadas en pacientes con CMT en Costa Rica, para determinar la importancia de cada mutación y correlacionar los síntomas con la mutación causante de CMT. Se analizaron 51 individuos diagnosticados con CMT por técnicas de secuenciación de ADN y MLPA, se llevó a cabo un análisis de correlación genotipo-fenotipo a través de Análisis de Coordenadas Principales (PCoA) y análisis de Similitudes (ANOSIM), y a partir de estos análisis se diseñó una estrategia de búsqueda de genes responsables según dicha correlación. Tomando en cuenta los estudios anteriores en nuestro país, se ha logrado hacer diagnóstico molecular de CMT en 20 familias, identificando 7 mutaciones en 5 genes evaluados. En esta investigación se logró realizar el diagnóstico molecular en 17 pacientes, en los cuales se determinó la presencia de la mutación Ala335Val (1004C>T) del gen MED25 en uno de ellos, la cual fue hallada en un paciente perteneciente a la misma familia donde se encontró por primera vez; la mutación Tyr145Ser (434 A>C) del gen MPZ en 4 pacientes, la mutación Val13Met (37G>A) del gen GJB1 se encontró en 6 pacientes, las mutaciones Gln163X/Ser194X (487C>T/581C>G) en el gen GDAP1 en un individuo, y la duplicación del gen PMP22 se encontró en 5 pacientes. Mutaciones en los genes GDAP1 y PMP22 no habían sido encontradas anteriormente en Costa Rica y al contrario de las...Ítem Diagnóstico molecular en dos familias afectadas con retinosis pigmentaria autosómica recesiva(1996) Leal Esquivel, Alejandro; Barrantes Mesén, RamiroSe denomina Retinosis Pigmentaria (RP) a un grupo de enfermedad es que se caracterizan por la degeneración de la retinar que provoca ceguera nocturna, reducción del campo visual, disminución de vascularidad y una pigmentación particular. Existen díversos tipos de herencia, heterogeneidad compuesta, y síndromes que presentan RP. La mayor cantidad de afectadas presentan un patrón autosómrco recesivo (RPAR), pero se desconocen la mayoría de los genes que lo causan. De 70 fam¡lias costarricenses con miembros afectados por RP, se escogieron dos con RPAR. La prímera es la familia C1, de San José con 10 afectados vivos y 14 portadores obligatorios. Los afectados presentan una degeneración de aparición temprana (ERG piano) y severa, RPAR típo 1 (bastón-cono). Se utilizaran marcadores polimórficos (STR Ps) para descartar algunas regiones relacionadas con la RP en la literatura, y se utilizó el programa LNKAGE para el analisis de ligamiento. El poder de ligamiento de la famrna es de Z (0.0)=4.49, con un marcador inventado de cuatro alelos con frecuencias igualadas. Los puntajes Lod permitieron descartar como causantes de la RP en esta familia (Z (0.0) = -¿), a los genes que codifícan por la fosfodiesterasa-B (4p), las proteínas que causan la RPARI. (1q), la RPAR III (3q) y la RPAR VI (6p), ), RP como Stargardt (6q), el causante de la RPAD en el cromosoma 8 (RP1) y el gen Myc (8q). Además se sugiere la exclusión del gen de la rodopsína (3q), los genes que provocan el Sindrome de Usher 1C (11p), Usher 2 (1q), y el causante de la distrofia cono-bastón (6q). Finalmente, en esta familia se encontraron algunos puntajes Lod posltivos, para los marcadores PDEB (Z (0.3)= 0.0329), D4s412 (cercano a PDEB, Z(0.2) =0.4341 ). RDS (Z(0.2) = 0.2239) y Myc (Z(0.2) = 0.3050), pero no a ¿ = 0.0...Ítem Diet and leukocyte telomere length in a population with extended longevity: the Costa Rican longevity and healthy aging study (CRELES)(Nutrients, 13(8), 2021) Ruiz Narváez, Edward A.; Baylin, Ana; Azofeifa Navas, Jorge; Leal Esquivel, Alejandro; Rosero Bixby, LuisElderly Costa Ricans have lower mortality rates compared to their counterparts from developed countries. Reasons for this survival advantage are not completely known. In the present study, we aimed to identify dietary factors associated with leukocyte telomere length (LTL), a marker of biologic aging, in the elderly population of Costa Rica. We conducted prospective analysis in 909 participants aged 60+ years from the Costa Rican Longevity and Healthy Aging Study (CRELES). We used a food frequency questionnaire to assess usual diet. We calculated dietary patterns using Principal Component Analysis (PCA). We used generalized linear models to examine the association of dietary patterns and food groups with leukocyte telomere length. We found two major dietary patterns explaining 9.15% and 7.18% of the total variation of food intake, respectively. The first dietary pattern, which represents a traditional Costa Rican rice and beans pattern, was more frequent in rural parts of the country and was positively associated with baseline LTL: (95% CI) = 42.0 base-pairs (bp) (9.9 bp, 74.1 bp) per one-unit increase of the traditional dietary pattern. In analysis of individual food groups, intake of grains was positively associated with baseline LTL: (95% CI) = 43.6 bp (13.9 bp, 73.3 bp) per one-serving/day increase of consumption of grains. Our results suggest that dietary factors, in particular a traditional food pattern, are associated with telomere length and may contribute to the extended longevity of elderly Costa Ricans.Ítem Estudio del gen Med25 como responsable de la neuropatía periférica hereditaria ARCMT2B(2006) Araya Callís, Carolina; Leal Esquivel, AlejandroLa enfermedad de Charcot-Marie-Tooth (CMT) constituye el grupo complejo más común de neuropatías sensoriales y motoras hereditarias (HMSN) que afecta el sistema nervioso periférico. El cuadro clínico se caracteriza por Ja atrofia y la debilidad progresivas de los músculos distales así como por ta disminución o ausencia de reflejos en los tendones. Además, CMT se encuentra frecuentemente asociada con una pérdida leve o moderada sensorial, así como con deformidades en las manos y los pies. Existen diversos tipos de herencia, con formas dominantes, recesivas y ligadas al X. En Costa Rica, se ha encontrado la causa de la enfermedad en dos familias con la forma autosómica dominante; una en Cartago (CR-C) y otra en Atenas (CR-D) ambas con mutaciones en el gen MPZ y además, se encontró ligamiento de la forma recesiva axonal con la región 19q13.3 en una extensa familia alajuelense consanguínea de ancestros principalmente de origen español (CR-P). Después de los análisis de secuencia, se encontró que los pacjentes de esta familia presentan una mutación en el exón 9 del gen Med25 (coactivador gen-especifico de la transcripción por parte de la ARN polimerasa II, asociado al complejo Mediador) que resulta en un cambio de una citosina por una t i.m ina en la posición 1044 (1044 C>T), que da como resultado el cambio de una alanina por una valina (Ala335Val) en la proteína codificada. Todos los pacientes en la familia CR-P han sido encontrados como homocigotos para Ja mutación, sin embargo se ha reportado un paciente de CMT en Alemania, que cuenta con la mutación de manera heterocigota. Hasta el momento no se ha detenninado con claridad la forma en que Med25 participa en la función neuronal, y por ello además de estudios que pemutan confirmar que el gen Med25 es el causante de la neuropatía periférica es necesario determinar compañeros de interacción proteica de Med25, que...Ítem Identificación de un posible gen causante de discapacidad cognitiva no sindrómica con herencia autosómica recesiva(2013) Lobo Prada, Tanya; Leal Esquivel, AlejandroLa discapacidad cognitiva no sindrómica (NS-ID) con herencia autosómica recesiva es una enfermedad heterogénea que afecta el sistema nervioso central e impide que los individuos afectados se valgan por sí mismos. Por medio de la secuenciación de nueva generación y regiones homocigotas idénticas por descendencia, es posible mapear genes causantes de NS-ID. Combinando estas técnicas moleculares en tres familias costarricenses con individuos afectados con discapacidad cognitiva severa se logró encontrar que una mutación no sinónima en el sitio activo del gen que codifica por la enzima GPT2 cosegrega con el fenotipo afectado en una familia. GPT2 es una transaminasa que cataliza una reacción irreversible en la que se produce glutamato. Es posible que un descenso en los niveles de glutamato impida la sincronización excitatoria de las neuronas durante procesos como el LTP (long term potentiation) involucrado en el aprendizaje y la memoria. Por lo tanto, GPT2 es un gen candidato de discapacidad cognitiva no sindrómica con herencia autosómica recesiva. Estos resultados contribuyen con el esclarecimiento de genes involucrados en el funcionamiento de la discapacidad cognitiva y fundamentan la búsqueda de alternativas terapéuticas para los individuos afectados.Ítem Una mutación en UDP-GlcNac: Dolicohol Fosfato N-acetilglucosamina-1-Fosfato transferasa (GPT) causa el fenotipo stpm365 en Danio rerio(2006) De La Guardia Orozco, Ana Catalina; Leal Esquivel, AlejandroIn this work we show that the zebrafish stpm365 mutation interferes with the craniofacial development by disrupting the gene that encades far the Gpt enzyme which is involved in the first critica/ step of the N-glycosylation pathway.